Es besteht eine enge Verbindung zum Institut für Baustoffe, Massivbau und Brandschutz (iBMB) der TU Braunschweig. Der Institutsleiter des Fraunhofer WKI, Prof. Dr.-Ing. Bohumil Kasal, ist gleichzeitig Inhaber des Lehrstuhls für »Organische Baustoffe« am iBMB und Initiator gemeinsamer Forschungsprojekte. Die Verknüpfung der Grundlagenforschung des iBMB mit der angewandten Forschung des Fraunhofer WKI schafft den Nährboden für zukunftsweisende Innovationen in der Baubranche.
Das Zentrum für leichte und umweltgerechte Bauten ZELUBA® des Fraunhofer WKI ist auf dem Campus der TU Braunschweig angesiedelt – in direkter Nachbarschaft zum iBMB sowie zu weiteren Bauinstituten der TU Braunschweig. Dies begünstigt den fachlichen Austausch zwischen den Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftlern des Fraunhofer WKI und der TU Braunschweig.
Eine gemeinsame, multidisziplinäre Forschernachwuchsgruppe untersucht derzeit das Langzeitverhalten und die Dauerhaftigkeit von Holz-Hybridsystemen für tragende Konstruktionen im Hochbau. Die Nachwuchsgruppe wird vom Bundesministerium für Ernährung und Landwirtschaft (BMEL) gefördert.
Das Fraunhofer WKI engagiert sich im Graduiertenkolleg »Modelle für die Beschreibung der Zustandsänderung bei Alterung von Baustoffen und Tragwerken« der TU Braunschweig. Das Fraunhofer WKI weist mehrere Doktoranden-Stellen für jeweils drei Jahre aus eigenen Mitteln aus. Die Doktoranden werden in das Graduiertenkolleg eingebunden, wenn die fachliche Nähe gegeben ist.
Darüber hinaus bestehen weitere Verbindungen zur TU Braunschweig im Rahmen von Lehraufträgen und Forschungsprojekten.